Název projektu
Zpracování a pokročilá analýza biomedicínských dat VIII
Kód
SP2023/076
Řešitel
Období řešení projektu
01. 01. 2023 - 31. 12. 2023
Předmět výzkumu
V oblasti analýzy biomedicínských dat dochází v posledních letech k novému pohledu na budoucnost reálného nebo potencionálního pacienta. Tento pohled se promítá do nových oblastí,
tzv. Precision Medicine (léčba vycházející z přesných dat o pacientovi.) a Precision Health (péče
o zdraví vycházející z přesných dat o (pacientovi.). Díky současným moderním laboratorním
zařízením v nemocnicích a na lékařských fakultách je získáváno nebývalé množství dále zpracovatelných dat. Tato data jsou díky novým technologiím na jedné straně velmi přesná, na
druhé straně se výzkumníci potýkají s různými problémy spojenými s nečistotami způsobenými zejména lidským faktorem. Mezi tyto problémy biomedicínských dat často patří jejich
neúplnost a nepřesnost. Při všech analytických přístupech je často potřeba zohlednit jak mimořádně velký rozsah zpracovávaných dat (např. sekvence DNA), tak jejich komplexnost (genetické a klinické profily pacientů spojené s vývojem v čase, se signálovými daty jako je EEG
apod.), což často vyžaduje paralelní a distribuované přístupy a specifické sekvence použití
metod v přesně definovaných procesech (pipelines).
Členové řešitelského týmu
RNDr. Eliška Ochodková, Ph.D.
doc. Mgr. Miloš Kudělka, Ph.D.
doc. Ing. Petr Gajdoš, Ph.D.
Ing. Michal Vašinek, Ph.D.
prof. RNDr. Václav Snášel, CSc.
Ing. Michal Radecký, Ph.D., MBA
Ing. Marek Běhálek, Ph.D.
RNDr. Ing. Martin Radvanský, Ph.D.
Ing. Jan Janoušek
Arootin Gharibian
Bc. Lukáš Jochymek
Ing. Vít Doleží
Bc. Emanuel Dopater
Ing. Markéta Vašinková
Mgr. Ondřej Janča
Ing. Kristýna Kubíková
Ing. Tomáš Anlauf
Ing. Lukáš Papík
Ing. Jakub Plesník
Bc. Petr Ptáček
Ing. Martin Radvanský
Bc. Adam Gaura
Ing. Jan Patschka
Bc. Jakub Šenk
Specifikace výstupů projektu (cíl projektu)
Cílem projektu je navázat na předcházející projekty a pokračovat tak ve výzkumu a vývoji
metod pro získávání skrytých informací z biomedicínských dat (biomeciacal data mining).
Projekt bude zacílen zejména na vysokou míru interdisciplinarity kombinující informatiku,
statistiku, lidskou medicínu a biologii zaměřenou zejména na genetiku.
Výzkum bude směřovat do oblasti vývoje, experimentálního ověření a aplikace moderních
přístupů, a také návrhu nových postupů a metod pro získávání informací a znalostí z dat. Tyto
postupy vycházejí z metod v oblasti výpočetní inteligence (bio-inspirované výpočty, analýza
signálů, komplexních sítí apod.) a využívají se ke zpracování komplexních dat, tedy dat s nepravidelnou a netriviálně popsatelnou strukturou. Vyvinuté metody a algoritmy budou konfrontovány s výsledky tradičních přístupů a budou podrobeny exaktnímu vyhodnocení. Metody vyvinuté v předchozích projektech budou využity a doplněny v rámci tohoto projektu.