Odborné skupiny fakulty
Katedra kybernetiky a biomedicínského inženýrství
Biomedicínské inženýrství
Biomedicínské inženýrství je nový, rychle expandující interdisciplinární nelékařský obor, který v sobě spojuje inženýrské, fyzikální, matematické, biologické a lékařské přístupy. Biomedicínské inženýrství přispívá k rozvoji lékařské vědy a lékařských technologií.
Výzkumná témata:
- Návrh a konstrukce přístrojové zdravotnické techniky
- Testování a kalibrace přístrojové techniky pro zdravotnictví
- Měření a zpracování biosignálů
- Telemedicínské systémy - návrh, testování a analýza přesnosti měření
- Znalostní podpora zdravotnických systémů
- Zpracování biomedicísnkých signálů
- Využití umělé inteligece při podpoře diagnostiky z medicínských dat
- Využití FPGA pro rychlé analýzy a zpracování dat
- Návrhy a biomedicínských sensorů
- Speciální zdravotnické přístroje - návrh, tesování a konstrukce
- Asistivní technologie
- Zpracování medicínských obrazů
- Využívání metod umělé inteligence
Vedoucí skupiny: prof. Ing. Martin Černý, Ph.D.
Laboratoře
Biomedicínské inženýrství disponuje 4 plně vybavenými laboratořemi. Každá se zaměřuje na jinou výzkumnou činnost.
EB309 - Laboratoř zobrazovací techniky v lékařství a telemetrie
EB310 - Laboratoř biomedicínské přístrojové techniky
EB311 - Laboratoř biomedicínských senzorů a měření
HEALTH.lab - Laboratoř asistivních technologií a telemedicíny 1
HEALTH.lab - Laboratoř asistivních technologií a telemedicíny 2
Galerie laboratoří
Spolupráce
Spolupráce s partnery:
- FAKULTNÍ NEMOCNICE OSTRAVA - Nemocnice s naší skupinou spolupracuje v oblasti výuky, vědy a výzkumu.
- MĚSTSKÁ NEMOCNICE OSTRAVA - Nemocnice s naší skupinou spolupracuje v oblasti výuky, vědy a výzkumu.
- FAKULTNÍ NEMOCNICE OLOMOUC - Nemocnice s naší skupinou spolupracuje v oblasti výuky, vědy a výzkumu.
- NEMOCNICE S POLIKLINIKOU HAVÍŘOV - Nemocnice s naší skupinou spolupracuje v oblasti výuky, vědy a výzkumu.
- NEMOCNICE PODLESÍ- Nemocnice s naší skupinou spolupracuje v oblasti výuky, vědy a výzkumu.
- SLEZSKÁ NEMOCNICE V OPAVĚ - Nemocnice s naší skupinou spolupracuje v oblasti výuky, vědy a výzkumu.
- NEMOCNICE JABLONEC NAD NISOU, P.O. - Nemocnice s naší skupinou spolupracuje v oblasti výuky, vědy a výzkumu.
- AGEL - Společnost AGEL a.s. je největším soukromým poskytovatelem zdravotní péče ve střední Evropě. V současné době provozuje v České republice jedenáct nemocnic a několik dalších zdravotnických zařízení. Především funguje v oblasti Moravskoslezského a Olomouckého kraje. Každoročně je pak v nemocnicích holdingu AGEL hospitalizováno víc než 170 tisíc pacientů.
Skupina spolupracuje s řadou předních zahraničních univerzit a svým studentům nabízí až roční studium na partnerské zahraniční univerzitě.
Mazi hlavní partnerské univerzity v oboru biomedicínského inženýrství patří:
- University Roma Tre
- University Grenoble Alpes (Polytech Grenoble)
- University Claude Bernard Lyon 1 (Polytech Lyon)
- University of Porto
- Technická univerzita Košice
- Polytechnika Slaska, Fakulta Biomedicínské inženýrství
Loga
Projekty
- Černý Martin prof. Ing., Ph.D.: Vývoj prototypu a komerční využití zakázkové smart AFO ortézy, Ministerstvo průmyslu a obchodu (2026 - 2027)
- Augustynek Martin prof. Ing., Ph.D.: EGMedical, s.r.o. - Aplikace 3 - Kontinuální monitorování a diagnostika metabolismu glukózy, Ministerstvo průmyslu a obchodu (2025 - 2028)
- Černý Martin prof. Ing., Ph.D.: SMARTTEST - European Doctoral Network for Resilient Remote Healthcare using Intelligent Sensing and Communication Technologies , Evropská unie (2025 - 2027)
- Penhaker Marek prof. Ing., Ph.D.: Neinvazivní on-line monitoring pacienta s prvky umělé inteligence, Ministerstvo průmyslu a obchodu (2024 - 2026)
- Augustynek Martin prof. Ing., Ph.D.: Vývoj systému pro biometrickou zpětnovazební diagnostiku psychických obtíží jedince a jejich redukce autoterapií, Ministerstvo průmyslu a obchodu (2024 - 2026)
- Penhaker Marek prof. Ing., Ph.D.: LERCO - Life Environment Research Center, Ministerstvo životního prostředí (2023 - 2027)
- Penhaker Marek prof. Ing., Ph.D.: Výzkum a vývoj nového systému MEDIMONITOR pro inteligentní prognózování vývoje diagnóz, Ministerstvo průmyslu a obchodu (2021 - 2023)
- Augustynek Martin prof. Ing., Ph.D.: Nová modulární platforma pro biometrická nositelná zařízení s rozšířenou analýzou fyziologických veličin, Ministerstvo průmyslu a obchodu (2021 - 2023)
- Augustynek Martin prof. Ing., Ph.D.: Chytrý neuro-rehabilitační systém pro pacienty se získaným poškozením mozku v časných stádiích léčby, Technologická agentura ČR (2019 - 2021)
- Augustynek Martin prof. Ing., Ph.D.: Integrovaný aktivní monitorovací systém pro pacienty s externími kardiostimulátory, Technologická agentura ČR (2018 - 2021)
- Penhaker Marek prof. Ing., Ph.D.: Vývoj zdravotních prostředků jako efektivní investice pro veřejné i soukromé subjekty, Technologická agentura ČR (2018 - 2021)
- Černý Martin prof. Ing., Ph.D.: Vývoj zařízení pro vzdálené ověření správné funkce externích kardiostimulátorů, Technologická agentura ČR (2018 - 2019)
- Augustynek Martin prof. Ing., Ph.D.: Hodnocení investic do vývoje zdravotních prostředků, Grantová agentura ČR (2017 - 2019)
Publikace
- Coelho, M., Černý, M., Tavares, J. (2023). Deep learning methods to detect Alzheimer [detail...]
- Barvík, D., Černý, M., Noury, N. (2023). The Capacitive Sensing of the Pulsatile Liquid Flow - Investigation on a Physical Vascular Model, IEEE Transactions on Instrumentation and Measurement, 72, nestránkováno [detail...]
- Proto, A., Schmidt, M., Vondrák, J., Kubíček, J., Paterno, G., Jargus, J., Penhaker, M. (2024). Wearable device for body heat energy harvesting in real-life scenarios, Sensors and Actuators, A: Physical, 379, nestránkováno [detail...]
- Timkovič, J., Nowaková, J., Kubíček, J., Hasal, M., Varyšová, A., Kolarčík, L., Maršolková, K., Augustynek, M., Snášel, V. (2024). Retinal Image Dataset of Infants and Retinopathy of Prematurity, Scientific data, 11, nestránkováno [detail...]
- Almeida, J., Kubíček, J., Penhaker, M., Černý, M., Augustynek, M., Varyšová, A., Bansal, A., Timkovic, J. (2024). Enhancing ROP plus form diagnosis: An automatic blood vessel segmentation approach for newborn fundus images, Results in Engineering, 24, nestránkováno [detail...]
- Vondrák, J., Penhaker, M., Kubíček, J. (2024). Detection of myocardial infarction using analysis of vectorcardiographic loops, Measurement, 226, nestránkováno [detail...]
- Kijonka, J., Vavra, P., Penhaker, M., Kubíček, J. (2024). Representative QRS loop of the VCG record evaluation, Frontiers in Physiology, 14, nestránkováno [detail...]
- Oczka, D., Augustynek, M., Penhaker, M., Kubíček, J. (2024). Electrogastrography measurement systems and analysis methods used in clinical practice and research: comprehensive review, Frontiers in Medicine, 11, nestránkováno [detail...]
- Kijonka, J., Vavra, P., Penhaker, M., Bibbo, D., Kudrna, P., Kubíček, J. (2024). Present results and methods of vectorcardiographic diagnostics of ischemic heart disease, Computers in Biology and Medicine, 169, nestránkováno [detail...]
- Genc, MZ., Dalveren, Y., Kara, A., Derawi, M., Kubíček, J., Penhaker, M. (2025). SVNC-Net: An optimized U-Net variant with 2D convolutions for lightweight 3D spleen segmentation, PLoS One, 20, nestránkováno [detail...]
- Malaník, P., Drahanský, M., Kubíček, J., Mňuk, T., Musilová, M., Mohelníková, J. (2025). EYRINA: A device for automatic capture of extended retinal images, Measurement, 253, nestránkováno [detail...]
- Procházka, M., Kašík, V., Litschmannová, M., Penhaker, M. (2025). Educational CT Scanner Model Realization: A Case Study Using Laser Emitter and 3-D Printing, IEEE Transactions on Instrumentation and Measurement, 74, 2006110 [detail...]
- Reyes Leiva, KM., Vondál, M., Yang, M., Černý, M., Wang, Y. (2025). Estimating respiratory rate in freely moving users using independent component and multi-resolution analysis, Computers in Biology and Medicine, 197, 1-9 [detail...]
- Bansal, A., Kubíček, J., Penhaker, M., Augustynek, M. (2025). A comprehensive review of optic disc segmentation methods in adult and pediatric retinal images: from conventional methods to artificial intelligence (CR-ODSeg-AP-CM2AI), Artificial Intelligence Review, 58, nestránkováno [detail...]
- Sethia, K., Strakoš, P., Jaroš, M., Kubíček, J., Roman, J., Penhaker, M., Říha, L. (2025). Advances in liver, liver lesion, hepatic vasculature, and biliary segmentation: a comprehensive review of traditional and deep learning approaches, Artificial Intelligence Review, 58, 299 [detail...]
- Barvík, D., Černý, M., Procházka, M., Noury, N. (2026). Pulse Wave Velocity Estimation in a Controlled In Vitro Vascular Model: Benchmarking Machine Learning Approaches, Sensors, 26, 1066 [detail...]
- Reyes Leiva, KM., Gupta, A., Grosmaire, A., Prochazkova, S., Matouch, P., Zavacka, I., Skroch, J., Černý, M. (2026). SiViS: Simulated multi-patient physiological clinical states for advanced vital sign radar monitoring research, Scientific data, 13, nestránkováno [detail...]
- Kubíček, J., Fiedorová, K., Vilímek, D., Černý, M., Penhaker, M., Janura, M., Rosický, J. (2020). Recent Trends, Construction and Applications of Smart Textiles and Clothing for Monitoring of Health Activity: A Comprehensive Multidisciplinary Review, IEEE Reviews in Biomedical Engineering, neuveden, nestránkováno [detail...]
- Proto, A., Vondrák, J., Schmidt, M., Kubíček, J., Majidzadeh Gorjani, O., Havlik, J., Penhaker, M. (2021). A Flexible Thermoelectric Generator Worn on the Leg to Harvest Body Heat Energy and to Recognize Motor Activities: A Preliminary Study, IEEE Access, 9, 20878-20892 [detail...]
- Barvík, D., Černý, M., Penhaker, M., Noury, N. (2021). Noninvasive Continuous Blood Pressure Estimation from Pulse Transit Time: A review of the calibration models, IEEE Reviews in Biomedical Engineering, Neuveden, nestránkováno [detail...]
- Bajgarová, K., Augustynek, M., Kubíček, J., Kudrna, P., Bibbo, D. (2022). Review of present method of glucose from human blood and body fluids assessment, Biosensors and Bioelectronics, 211, nestránkováno [detail...]
- Kijonka, J., Vavra, P., Zonca, P., Penhaker, M. (2022). A wavelet-based VCG QRS loop boundaries and isoelectric coordinates detector, Frontiers in Physiology, 13, nestránkováno [detail...]
- Foltyn, J., Proto, A., Oczka, D., Halfar, R., Klinkovský, T., Skoloudik, L., Cerny, M., Chrobok, V., Ryška, A., Radochova, V., Litschmannová, M., Penhaker, M., Mejzlik, J. (2019). Evaluation of an Electro-Pneumatic Device for Artificial Capillary Pulse Generation used in a Prospective Study in Animals for Surgical Neck Wound Healing, Scientific Reports, 9, nestránkováno [detail...]
- Černý, M., Ohnůtková, P., Kubíček, J., Glombíková, V., Kůs, Z., Vojtenko, O. (2026). Optimizing cranial orthotic design: Experimental evaluation of thermal comfort in 3D-printed vs. thermoplastic orthoses, Applied Thermal Engineering, 284, 129155-129155 [detail...]
- Reyes Leiva, KM., Nikelová, P., Černý, M. (2026). Anthropometry and diagnostic aware deep learning for exercise assessment, Frontiers in Medical Technology, 7, nestránkováno [detail...]
- Vondrák, J., Penhaker, M. (2026). Enhancing myocardial infarction detection with vectorcardiography: fusion-based comparative analysis of machine learning methods, Frontiers in Physiology, 16, nestránkováno [detail...]
- Kauzlaričová, T., Augustynek, M., Kubíček, J. (2026). Advancements in Noninvasive Blood Pressure Measurement: A Comprehensive Review of Cuffed, Cuffless, and Contactless Methods, IEEE Transactions on Instrumentation and Measurement, 75, 1-30 [detail...]
Aplikační výsledky
- Chadrabová, M., Kubíček, J., Augustynek, M. (2025). Software pro analýzu retinálních lézí pro systémy Clarity RetCam 3 a Icon PHOENIX, FEI VŠB-TU Ostrava SOFTWARE [detail...]
- Procházka, M., Kašík, V. (2022). Výukový model výpočetního tomografu, Úřad průmyslového vlastnictví PATENT, UŽITNÝ VZOR, PRŮMYSLOVÝ VZOR [detail...]
- Hrubý, D., Černý, M., Kašík, V. (2024). Software pro detekci pádů z FMCW radarů, Vysoká škola báňská - Technická univerzita Ostrava SOFTWARE [detail...]
- Kubíček, J., Penhaker, M., Válek, M. (2023). RTG_Spine_Analysis, FEI VŠB-TU Ostrava SOFTWARE [detail...]
- Augustynek, M., Černý, M., Kašík, V., Grepl, J., Bajgarová, K., Varyšová, A., Vondrák, J., Schmidt, M., Kotyrba, M., Smolka, P., Jaremová, V., Vantuch, J., Nilius, P. (2023). Zařízení pro rozvoj kognitivních funkcí, Úřad průmyslového vlastnictví PATENT, UŽITNÝ VZOR, PRŮMYSLOVÝ VZOR [detail...]
- Augustynek, M., Černý, M., Kašík, V., Grepl, J., Bajgarová, K., Varyšová, A., Vondrák, J., Schmidt, M., Kotyrba, M., Smolka, P., Jaremová, V., Vantuch, J., Nilius, P. (2023). Hrací kostka, hrací podložka, sestava kostek a hrací podložky, Úřad průmyslového vlastnictví PATENT, UŽITNÝ VZOR, PRŮMYSLOVÝ VZOR [detail...]
- Černý, M., Peter, L., Bajgarová, K., Tomášek, R., Rosický, J. (2022). Textilní senzor pro analýzu chůze, Úřad průmyslového vlastnictví PATENT, UŽITNÝ VZOR, PRŮMYSLOVÝ VZOR [detail...]
- Barvík, D., Klinkovský, T., Kašík, V., Peter, L., Táborský, P., Černý, M. (2020). Systém pro vzdálené ověření správné funkce externího kardiostimulátoru, Úřad průmyslového vlastnictví PATENT, UŽITNÝ VZOR, PRŮMYSLOVÝ VZOR [detail...]
- Grepl, J., Augustynek, M., Černý, M., Horyl, P., Penhaker, M., Kuča, K., Marešová, P., Krejcar, O. (2020). Diagnostický rehabilitační nástroj měření kloubního rozsahu, Úřad průmyslového vlastnictví PATENT, UŽITNÝ VZOR, PRŮMYSLOVÝ VZOR [detail...]
- Barvík, D., Černý, M. (2020). Zařízení pro detekci pohybu a přítomnosti lidského těla v ortotických a protetických pomůckách, Úřad průmyslového vlastnictví PATENT, UŽITNÝ VZOR, PRŮMYSLOVÝ VZOR [detail...]
- Grepl, J., Augustynek, M., Černý, M., Horyl, P., Penhaker, M., Kuča, K., Marešová, P., Krejcar, O. (2019). Diagnostický rehabilitační nástroj měření kloubního rozsahu, Úřad průmyslového vlastnictví PROTOTYP, FUNKČNÍ VZOREK [detail...]
Loga
Tým
Vedoucí skupiny
prof. Ing. Martin Černý, Ph.D.
Kontaktní osoba
prof. Ing. Martin Černý, Ph.D.
Akademičtí pracovníci:
prof. Ing. Martin Augustynek, Ph.D., Ing. Daniel Barvík, Ph.D., Ing. Kryštof Capek, prof. Ing. Martin Černý, Ph.D., Ing. Marie Chadrabová, Ing. Blanka Filipová, Ph.D., Ing. Vladimír Kašík, Ph.D., Ing. Jan Kubíček, Ph.D., prof. Ing. Marek Penhaker, Ph.D., Chiara Pollastrini, Ing. Jaroslav Vondrák, Ph.D.
Vědečtí pracovníci:
Ing. Jana Krymlák Bahrová, Avinash Bansal, Ph.D., Shalini Garg, Ing. Jan Grepl, PhD., Ankit Gupta, Ing. Bc. Martin Haváček, Ing. Jan Hečko, Ph.D., Ing. Dan Hrubý, Sumit Kaushik, Ph.D., Dr. Rouhollah Kian Ara, Ing. Jan Kijonka, Ph.D., RNDr. Ing. Juliana Alexandra Knociková, PhD., Ing. Terezie Kauzlaričová, Ing. Martin Losert, Ing. Nikol Malinová, Giovanni Marinaro, Ing. Roman Melecký, PhD., Ing. David Oczka, Ph.D., Ing. Michal Procházka, prof. Ing. Valentýna Provazník, Ph.D., Karla Miriam Reyes Leiva, Ing. Kamil Slaný, Ing. Marek Sonnenschein, Ing. Eva Hrubá, Mgr. Ing. Petr Uličný
Doktorandi:
MUDr. Jitka Homolová, Ing. Tereza Hrnčířová, Ing. Lucie Kohoutková, Ing. Tomáš Mimra
Externisté:
prof. Faouzi Alya Cheikh, prof. Ondřej Krejcar, prof. Azeddine Beghdadi, Yaser Dalveren Ph.D., Mohammad Derawi Ph.D., Hamidreza Namazi Ph.D., Ayan Seal Ph.D.